福建省慢性HBV感染者HBV基因S区、基本核心启动子区和前C区基因变异特征分析

李东1 杨秀惠1,2 陈致飞1 张苏晗1 郑凝旋1 潘伟毅1,2 周勇1,2 郑奎城1,2

(1.福建省疾病预防控制中心福建省人兽共患病重点实验室, 福州 350001)
(2.福建医科大学公共卫生学院教学基地, 福州 350001)
【创新点】文章根据前期研究选取了HBV基因S区,基本核心启动子区(BCP)及前C区的序列变异作为讨论重点,先前的文章多是研究其中的一个基因功能区。本文共同讨论了三个功能区,并发现这些变异可能造成病毒抗原表达,疫苗逃逸,患者病症改变等,应加强发生这些变异患者的监测。

【摘要】为研究福建省慢性HBV感染者HBV基因多样性及变异规律,了解该人群HBV-DNA的病毒学特征。收集慢性HBV感染者血清标本,通过巢式PCR法扩增其HBV基因序列,比对NCBI数据库中标准基因型序列,分析HBV基因S区,基本核心启动子区(BCP)及前C区的序列变异情况,并对这些变异可能造成的病毒抗原表达,疫苗逃逸,患者病症改变等情况进行探讨。最终成功扩增82例HBV全长基因序列,其中B基因型56例,C基因型26例。基因组特定功能区序列分析发现慢性HBV感染者HBV基因在S区(23.2%)、BCP区(61.0%)和前C区(29.3%)均出现了不同程度的变异。其中主蛋白(HBsAg)主要抗原决定簇a决定簇45.8%位点出现了变异,这些变异位点中包括与肝炎重症化及免疫逃逸密切相关的位点(aa126、aa129、aa145等)。位点G1896A(19.5%),G1764A(11.0%)和A1762T(9.8%)依然是BCP/前C区的主要突变位点。而位点A1752G(25.6%)高突变率的出现在BCP区应引起关注。此外位点G1764A(χ2=5.742,P=0.030)、A1896G(χ2=14.392,P=0.000)以及A1762T/G1764A(χ2=7.289,P=0.012)的突变更容易发生在HBeAg阴性的样品中;而位点A1846T(χ2=11.882,P=0.003)、A1762T(χ2=6.561,P=0.038)和A1896G(χ2=6.958,P=0.030)的突变与HBV-DNA的病毒载量存在一定相关性。总之,福建省慢性HBV感染者在HBV不同基因功能区域均存在不同程度的变异,一些与HBeAg表达情况、HBV-DNA载量、疫苗免疫逃避及肝细胞癌发生具有相关联的变异位点已经出现,BCP区A1752G位点的高频率出现应值得关注,对于这些变异位点的患者应加强监测。

【关键词】 乙型肝炎病毒(HBV); 基因变异;基本核心启动子(BCP); 前C区;

【DOI】

【基金资助】 国家科技重大专项(项目号:2012ZX10002001-002-002),题目:艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治 Funding:The present work was supported by the National Science and Technology Major Project of the Ministry of Science and Technology of China(2012ZX10002001-002-002;2017ZX10103008-004) 国家科技重大专项(项目号:2017ZX10103008-004),题目:浙江及周边省传染病病原谱流行规律研究——五大症候群病原谱监测

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This Article

ISSN:1000-8721

CN: 11-1865/R

Vol 34, No. 04, Pages 491-497

June 2018

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